高粱广谱抗蚜基因SSH文库的构建及其序列分析

• 作者: KhalidHussain 孙权 常金华 林凤 齐金凤
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 高梁 抗蚜基因 抑制性消减杂交 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 农学—研究报告
• 页码范围: 48-54
• 分类号: Q291
• 字数: 2828字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.09.010

摘要

为了从分子水平上解析高粱广谱抗蚜基因在高粱与蚜虫互作中的分子遗传基础和作用机理,为发掘并利用抗蚜基因提供可靠的信息支持.以高粱抗蚜品种‘河农16’与感蚜品种‘千三’为实验材料,构建抑制性消减杂交(SSH)文库,使差异抗蚜基因得到富集,对有效差异基因序列进行序列分析.随机挑选SSH文库中的200个阳性克隆进行测序和分析,得到18条ORF序列,同NCBI数据库进行Blastx在线比对和相似性分析,发现这些序列与叶绿体放氧增强相关蛋白、腺苷酸环化相关蛋白、核糖体蛋白、衰老联合蛋白高度相关.不具有ORF的序列,通过NCBI利用Blastn和Blastx进行序列同源性比对和相似性分析,发现66条与已知多种植物抗病序列有较高的同源性,如核糖体蛋白、转运膜蛋白、NBS-LRR抗病蛋白家族-1、锌指蛋白、ATP合酶、NADH脱氢酶、反转录转座子、腺苷酸环化相关蛋白、bZIP转录因子等,还有部分序列与高粱抗条锈病基因高度相似.这些同源基因涉及次生代谢、能量代谢、膜运输、细胞信号传递和转录调控等多种过程.成功构建高粱抗蚜基因SSH文库,表明SSH技术在高粱抗蚜机制研究中具有可行性,研究结果为进一步高梁抗蚜基因功能研究奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常金华	河北农业大学农学院	44	545	14.0	22.0
2	林凤	沈阳农业大学生物科学技术学院	47	584	14.0	22.0
3	孙权	沈阳农业大学生物科学技术学院	20	105	4.0	10.0
4	齐金凤	沈阳农业大学生物科学技术学院	1	2	1.0	1.0