2007年至2008年昆明地区腹泻患儿轮状病毒非结构蛋白基因特征的分析

• 作者: 侯宗柳 刘梅 周丽芳 戚勤 杨娟 赵亚玲 黄永坤
• 来源期刊: 昆明医学院学报
• 学科: 医学
• 关键词: 轮状病毒 NSP4 基因 变异
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 80-83
• 分类号: R723.11
• 字数: 3861字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-4706.2012.02.020

摘要

目的 探讨轮状病毒非结构蛋白(NSP4)基因的特征及变异情况.方法 在2007年和2008年昆明医学院第一附属医院儿科住院的96例秋冬季腹泻患儿中,随机选取轮状病毒阳性的12例(其中2007年6例,2008年6例)患儿粪便标本,采用RT-PCR扩增NSP4基因,并进行测序,测序结果 用DNAassist软件对核苷酸序列进行翻译,并用Clustal-mp软件与Genbank Datebase中的4株人RV(Wa、KUN、AU-1、Hochi)、3株动物RV(EW、OSU、SAll)和中国北京、上海、广州的流行株的NSP4序列进行分析比较.结果 (1)选取的2007年6份和2008年6份样本均可以扩增出NSP4的全长片段,测序表明:2007年6份样本中有5株属于Wa株,1株属于KUN株;2008年6份样本中也有5株属于Wa株,1株属于KUN株.10株Wa株与来自GenBank Database的4株人RV(wa、KUN、AU-1、Hochi)和3株动物RV(EW、OSU、SAll)同源性分别为96.3%、85.3%、84.7%、95.1%和57.7%、92%、82.8%,与中国北京、上海、广州的流行株同源性均在95%以上;2株KUN株与以上来自GenBank Database的标准株的同源性分别为85.3%、98.2%、82.8%、85.9%、60.1%、85.3%、94.3%,和其他地区流行株的同源性为85%左右; (2)以Wa株为参考,10株Wa株的NSP4基因变异发生在第34位氨基酸,第76位氨基酸,第141位氨基酸,第145位氨基酸,第161位氨基酸和第169位氨基酸;以KUN株为参考,2株KUN株的NSP4基因变异仅在第87位氨基酸和第140位氨基酸.结论 2007年和2008年昆明地区流行株NSP4基因为Wa组和KUN组,以Wa组为主.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄永坤	昆明医学院第一附属医院儿科	115	803	17.0	23.0
2	周丽芳	昆明医学院第一附属医院儿科	34	226	10.0	13.0
3	杨娟	昆明医学院第一附属医院儿科	11	54	4.0	7.0
4	刘梅	昆明医学院第一附属医院儿科	34	161	7.0	11.0
5	戚勤	昆明医学院第一附属医院儿科	26	177	7.0	12.0
6	侯宗柳	昆明市延安医院中心实验室	13	24	2.0	4.0
7	赵亚玲	昆明医学院第一附属医院儿科	13	75	4.0	8.0