半番鸭羽色相关基因均一化差减文库的构建和鉴定

• 作者: 卢立志 朱志明 缪中纬 肖天放 辛清武 郑嫩珠 陈晓燕 陈晖
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 半番鸭 羽色基因 双链特异性核酸酶(DSN) 消减杂交 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2012,（22）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 4688-4696
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.22.015

摘要

[目的]分离半番鸭羽色相关基因,探索半番鸭羽色基因表达调控的分子机制.[方法]以半番鸭白羽皮肤和黑羽皮肤分别作为试验组(tester)和驱动组(driver),利用双链特异性核酸酶(duplexspecific nuclease,DSN)介导的均一化消减杂交方法,构建半番鸭羽色相关基因消减cDNA文库,同时采用实时荧光定量PCR方法对文库质量进行验证.[结果]①从文库中随机选取144个阳性克隆进行测序分析,最终共获得64条有效序列,平均长度为1 031 bp;经BLAST比对发现,21条具有同源序列,且同源性平均为92.8％;43条未找到匹配序列,推测可能为羽色相关新基因;②Geneontology功能分析表明,已知基因参与信号转导、细胞结构、物质转运、细胞凋亡、细胞与机体防御、转录与表达调控等诸多生物学过程,并且与色素形成和转运存在不同程度的相关性.[结论]经实时荧光定量PCR鉴定后,所建文库质量良好,能够有效地富集白羽皮肤特异表达基因.