B环不同羟基取代影响黄酮苷元透膜能力的分子动力学模拟研究

• 作者: 刘鹏 卜晓斐 孟凡翠 徐为人 段桂运 汤立达 郝本前
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 黄酮苷元 羟基取代 氢键 静电作用 范德华作用 分子动力学模拟 透膜能力
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 药理与临床
• 页码范围: 1553-1559
• 分类号: R285.5
• 语种: 中文

摘要

目的 利用分子动力学模拟方法研究黄酮苷元B环不同羟基取代对透膜能力的影响规律,并考察理论方法与实验结果的相关性.方法 利用GROMACS程序包,通过附加加速度的分子动力学模拟方法得到5种黄酮苷元在双层脂质膜9个不同位置的轨迹,分析分子透膜过程中的能垒、方向性、氢键、相互作用等参数.结果 分子动力学模拟数据与文献报道人结肠腺癌Caco-2细胞实验数据具有良好的相关性(r=-0.7862),分子透过磷脂酰胆碱(DPPC)膜的能垒越小,越有利于药物分子透过生物膜.黄酮苷元透膜难易受静电的影响大于范德华作用的影响,分子在膜内形成氢键能力越强,滞留时间就越长.2′位取代可以增加分子各羟基形成氢键的能力,3′或5′位存在羟基时,与极性层适当的静电排斥作用有利于分子透过极性层.结论 B环不同位置取代对黄酮苷元透膜过程中的氢键形成能力、方向、静电相互作用和能垒都有明显的影响,理论模拟的能垒可以作为预测黄酮类化合物透膜吸收的一个重要指标.