番木瓜畸形花叶病毒外壳蛋白基因的克隆及序列分析

• 作者: 吴丽娟 孙雪飘 张家明 汪倩 谭德冠
• 来源期刊: 江苏农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 番木瓜环斑病毒 畸形花叶病毒 外壳蛋白 相似性 系统发育树
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 18-21
• 页数: 4页
• 分类号: Q785
• 字数: 3243字
• 语种: 中文

摘要

从海南乐东的感病番木瓜叶片上提取总RNA,用RT-PCR方法扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)外壳蛋白基因组序列.测序结果显示,该环斑病毒外壳蛋白基因扩增片段长867个核苷酸.相似性分析表明,该核苷酸序列与GenBank中报道的47株PRSV和1株畸形花叶病毒核苷酸序列的相似性在62.41％ ～94.71％之间.运用CLUSTALX和MEGA软件绘制系统进化树,结果表明,番木瓜PRSV病毒大致可分为美洲-澳洲类群和东亚-东南亚类群2大类,后者又可分为SB1、SB2、SB3等3个亚类.乐东毒株和已报到的畸形花叶病毒PaMLV病毒都属于PRSV.不过乐东毒株属于SB1亚类,而PaMLV属于SB2亚类.乐东毒株(JQ318029)和另一海南毒株(HQ424465)属于SB1亚簇,信心指数分别达到89％、83％、96％.不过乐东毒株与越南北部的4种毒株(AF506875、FN808408、AJ875115、U14742)的同源性更高,说明导致乐东畸形花叶病的毒株可能来自越南,而不是由海南本地毒株变异而来.