不同植物查尔酮合成酶CHS基因的生物信息学分析

• 作者: 张弢
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 查尔酮合成酶 生物信息学 功能分析 结构预测
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 5-8
• 分类号: Q811.4
• 字数: 2753字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8581.2012.06.002

摘要

采用生物信息学方法对GenBank中已登录的10种不同植物中的查尔酮合成酶基因的核苷酸序列及所推测的氨基酸序列的理化性质、信号肽、跨膜结构、亲/疏水性、功能结构域以及其二级结构进行了详细的分析,构建了不同植物CHS的系统进化树.结果表明,10种植物中CHS基因的开放阅读框的全长在1.2kb左右,大约编码399个氨基酸；不同植物中的CHS的氨基酸序列均包括1个N-糖基化位点(32NMSS),4个蛋白激酶c磷酸化位点(69TIR、158SVK、202TFR、359SAK)和1个查尔酮合成酶活性位点(161RLMMYQQGCFAGGTVLR),均不存在信号肤、无跨膜结构域,是一个疏水性蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张弢	青岛农业大学生命科学学院	19	128	7.0	10.0