一种基于蛋白质交互网络链接预测的新方法

• 作者: 尚学群 李晓园 李晶 郭阳
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 蛋白质交互网络 链接预测 权值网络 相关节点集 剪枝
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 4060-4063,4078
• 页数: 5页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2012.11.015

摘要

当前可用的生物数据在不断地迅速增长,仍有很多生物信息如蛋白质交互信息(protein-protein interaction,PPI)还未被发现,而这些潜在的或未知的信息对生物过程的研究是至关重要的.近年来,对未知生物信息的挖掘和研究吸引了很多人的关注.通过实验检测方法来发现这些信息是非常耗时耗力的,所以链接预测成为一种新的挖掘这些信息的指导方法.基于蛋白质交互网络并融合了基因表达数据信息,从拓扑和基因表达两个方面的信息来构建PPI权值网络,提出了一种在权值网络中基于相似度比较的链接预测的新方法来预测PPI网络中未知的交互信息.使用MIPS数据库评估了实验结果,表明了该算法有很好的准确率和良好的性能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚学群	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	23	67	5.0	5.0
2	李晶	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	12	280	5.0	12.0
3	李晓园	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	2	8	2.0	2.0
4	郭阳	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	3	8	2.0	2.0