毛果杨1-羟基-2-甲基-2-（E）-丁烯基-4-二磷酸合酶（HDS）基因的生物信息学分析

• 作者: 刘立辉 夏德安 李成浩 杨静莉
• 来源期刊: 农业科学与技术：英文版
• 学科: 农学
• 关键词: HDS 毛果杨 生物信息学 萜类
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 1-3,28
• 分类号: S
• 语种: 英文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-4229-B.2012.01.002

摘要

[目的]研究HDS基因问的同源性及其进化关系。【方法】以毛果杨的HDS基因为研究对象，利用生物信息学软件及网站对其进行碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、保守区以及二级结构和三级结构的预测与分析。并与其他10个物种的HDS基因序列进行多重比对与进化分析。[结果]毛果杨HDS基因的单链mRNA序列长1956bp，编码由656个氨基酸组成的蛋白质，该蛋白质相对分子质量为72937．03，其中含量最高的是I一，为10．50％；整个多肽中疏水性氨基酸只占39．63％，有10个亲水区和6个疏水区；与其他10个物种同源性多重比对发现同源性最高达99％。[结论]毛果杨HDS基因处于稳定状态，编码的蛋白为亲水性蛋白，在进化过程中是保守的；试验中获得的保守区段序列信息为新基因的克隆奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	夏德安		30	408	8.0	20.0
2	刘立辉		4	3	1.0	1.0
3	李成浩		22	59	4.0	7.0
4	杨静莉		9	32	2.0	5.0