功能基因组学方法筛选卵巢癌风险 microRNA

• 作者: 张广美 郭秋艳
• 来源期刊: 中国妇幼保健
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢癌 microRNA 功能基因组
• 年，卷（期）: 2012,（21）
• 所属期刊栏目: 遗传与优生
• 页码范围: 3315-3317
• 分类号: R737.31
• 语种: 中文

摘要

目的:寻找新的卵巢癌发病相关microRNA并为研究人员提供优化后的卵巢癌风险microRNA参照列表.方法:通过在生物网络中度量microRNA靶基因与卵巢癌基因间的功能相似性设计并实现优化卵巢癌风险microRNA计算学方法.采用留一法交叉证实检测该方法的准确性.应用该方法对人类1527个microRNA进行优化排序.结果:留一法交叉证实所得ROC曲线下面积0.92,该方法有着较高的灵敏度和特异度.排序后,一些已知的卵巢癌相关microRNA如let-7、miR-34/200排在了优化结果的前20位.与新一代测序数据结果进行比较,发现排序前20位microRNA中的大部分都在正常和卵巢癌组织中呈差异表达.结论:应用计算学方法可筛选出卵巢癌相关microRNA,并提供优化后的风险microRNA列表.miR-449a等7个未被报道与卵巢癌有关的miRNA有望成为新的卵巢癌相关的风险因子.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张广美	哈尔滨医科大学附属第一临床医学院妇产科	49	172	7.0	9.0
2	郭秋艳	哈尔滨医科大学附属第一临床医学院妇产科	6	7	2.0	2.0