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摘要:
背景:目前两种最可靠、应用最广的高通量RNA分离技术是基于异硫氰酸胍-酚︰氯仿的RNA分离技术和基于硅胶柱的RNA分离技术.在临床应用非常有限的组织材料时,有必要对RNA分离技术的可重复性和可靠性分别进行先期评价.目的:系统比较采用硅胶柱法和Trizol法从冻存、新鲜胃癌组织中分离总RNA的效果.方法:硅胶柱法和Trizol法分别提取长期-80 ℃冻存的(2年以上)和新鲜胃癌组织总RNA,紫外分光光度法比较RNA纯度,琼脂糖凝胶电泳分析28 S和18 S吸光度比值,进一步通过实时反转录-聚合酶链反应对扩增距mRNA polyA尾端不同大小片段的Ct值进行比较,间接判断不同大小mRNA的拷贝数及完整性.结果与结论:硅胶柱技术和Trizol方法在总RNA提取的纯度方面都表现很好.然而在RNA完整性方面,基于硅胶柱技术的提取方法要好于Trizol法,因为其核糖体RNA形式完好而且更好地保持了不仅短的及中等大小片段,对于较大的mRNA片段也保持更好.另外,与新鲜组织相比,长时间冻存对胃癌组织总RNA提取的影响很小.
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文献信息
篇名 长期冻存和新鲜胃癌组织总RNA提取方法的比较
来源期刊 中国组织工程研究 学科 医学
关键词 总RNA提取 胃癌 实时反转录-聚合酶链反应 异硫氰酸胍 Trizol 硅胶柱
年,卷(期) 2012,(24) 所属期刊栏目 技术与方法
研究方向 页码范围 4486-4490
页数 分类号 R318
字数 4697字 语种 中文
DOI 10.3969/j.issn.1673-8225.2012.24.024
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 夏作理 178 1480 18.0 29.0
2 赵晓民 78 482 13.0 18.0
3 韩纪举 29 246 8.0 15.0
4 叶文静 23 180 9.0 12.0
传播情况
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研究主题发展历程
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总RNA提取
胃癌
实时反转录-聚合酶链反应
异硫氰酸胍
Trizol
硅胶柱
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