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长期冻存和新鲜胃癌组织总RNA提取方法的比较
长期冻存和新鲜胃癌组织总RNA提取方法的比较
作者:
叶文静
夏作理
赵晓民
韩纪举
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
总RNA提取
胃癌
实时反转录-聚合酶链反应
异硫氰酸胍
Trizol
硅胶柱
摘要:
背景:目前两种最可靠、应用最广的高通量RNA分离技术是基于异硫氰酸胍-酚︰氯仿的RNA分离技术和基于硅胶柱的RNA分离技术.在临床应用非常有限的组织材料时,有必要对RNA分离技术的可重复性和可靠性分别进行先期评价.目的:系统比较采用硅胶柱法和Trizol法从冻存、新鲜胃癌组织中分离总RNA的效果.方法:硅胶柱法和Trizol法分别提取长期-80 ℃冻存的(2年以上)和新鲜胃癌组织总RNA,紫外分光光度法比较RNA纯度,琼脂糖凝胶电泳分析28 S和18 S吸光度比值,进一步通过实时反转录-聚合酶链反应对扩增距mRNA polyA尾端不同大小片段的Ct值进行比较,间接判断不同大小mRNA的拷贝数及完整性.结果与结论:硅胶柱技术和Trizol方法在总RNA提取的纯度方面都表现很好.然而在RNA完整性方面,基于硅胶柱技术的提取方法要好于Trizol法,因为其核糖体RNA形式完好而且更好地保持了不仅短的及中等大小片段,对于较大的mRNA片段也保持更好.另外,与新鲜组织相比,长时间冻存对胃癌组织总RNA提取的影响很小.
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文献信息
篇名
长期冻存和新鲜胃癌组织总RNA提取方法的比较
来源期刊
中国组织工程研究
学科
医学
关键词
总RNA提取
胃癌
实时反转录-聚合酶链反应
异硫氰酸胍
Trizol
硅胶柱
年,卷(期)
2012,(24)
所属期刊栏目
技术与方法
研究方向
页码范围
4486-4490
页数
分类号
R318
字数
4697字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1673-8225.2012.24.024
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
夏作理
178
1480
18.0
29.0
2
赵晓民
78
482
13.0
18.0
3
韩纪举
29
246
8.0
15.0
4
叶文静
23
180
9.0
12.0
传播情况
被引次数趋势
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引证文献(0)
二级引证文献(0)
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节点文献
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实时反转录-聚合酶链反应
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Trizol
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
中国组织工程研究
主办单位:
中国康复医学会
《中国组织工程研究与临床康复》杂志社
出版周期:
旬刊
ISSN:
2095-4344
CN:
21-1581/R
开本:
大16开
出版地:
沈阳浑南新区10002信箱
邮发代号:
8-584
创刊时间:
1997
语种:
chi
出版文献量(篇)
55677
总下载数(次)
80
总被引数(次)
337465
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