NDM-1型金属β-内酰胺酶的生物信息学分析

• 作者: 叶皓 周永君 殷建华 黄国娇
• 来源期刊: 西南国防医药
• 学科: 生物学
• 关键词: 新德里金属β-内酰胺酶1 生物信息学 同源序列 结构预测
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1161-1163
• 分类号: Q556
• 字数: 2098字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-0188.2012.11.001

摘要

目的 了解新德里金属β-内酰胺酶1(NDM-1)的氨基酸组成、理化性质、二三级结构和系统进化等,为进一步研究其作用机制和生物学功能奠定基础.方法 利用Compute pI/MW、ProtParam、SOPMA等生物信息学方法,对NDM-1进行分析.结果 NDM-1的等电点为5.07,疏水性GRAVY值为0.107;二级结构存在螺旋、折叠和转角等,没有信号肽和跨膜区域;三级结构由3个α-螺旋和4个β-折叠片组成;属于Family Lactamase_B (PF00753)蛋白质家族;其基因序列与海洋细菌(Erythrobacter litoralis) HTCC2594的β-内酰胺酶Ⅱ基因同源性最近.结论 NDM-1可能起源于环境,通过基因水平转移被传递给临床致病菌,并在抗生素的选择压力下,成为威胁人类健康的全球性问题.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶皓	成都医学院病原生物学教研室	1	3	1.0	1.0
2	周永君	成都医学院病原生物学教研室	1	3	1.0	1.0
3	黄国娇	成都医学院病原生物学教研室	2	3	1.0	1.0
4	殷建华	成都医学院病原生物学教研室	15	71	4.0	8.0