蛋白质相互作用网络特征的理论再现

• 作者: 万茜 刘曾荣 周进
• 来源期刊: 物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质相互作用网络 偏爱小 非均匀的异源二聚作用 功能模块结构
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 总论
• 页码范围: 15-22
• 分类号: Q811.4
• 语种: 中文

摘要

无标度性、小世界性、功能模块结构及度负关联性是大量生物网络共同的特征.为了理解生物网络无标度性、小世界性和度负关联性的形成机制,研究者已经提出了各种各样基于复制和变异的网络增长模型.在本文中,我们从生物学的角度通过引入偏爱小复制原则及变异和非均匀的异源二聚作用构建了一个简单的蛋白质相互作用网络演化模型.数值模拟结果表明,该演化模型几乎可以再现现在实测结果所公认的蛋白质相互作用网络的性质：无标度性、小世界性、度负关联性和功能模块结构.我们的演化模型对理解蛋白质相互作用网络演化过程中的可能机制提供了一定的帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘曾荣	上海大学系统生物技术研究所	52	607	12.0	24.0
2	周进	上海大学上海市应用数学与力学研究所	14	53	4.0	6.0
3	万茜	上海大学上海市应用数学与力学研究所	1	3	1.0	1.0