异构机群上高效可扩展的Motif发现并行算法

• 作者: 李锦 钟诚
• 来源期刊: 计算机科学
• 学科: 工学
• 关键词: DNA序列 Motif发现 并行算法 异构机群 数据分配模型
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 体系结构
• 页码范围: 279-282
• 分类号: TP338.6|TP301.6
• 字数: 4041字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-137X.2012.03.064

摘要

在节点具有不同计算速度、不同通信能力的异构机群系统上,分别建立求解l≤16和l＞16的Motif发现问题的最优序列分配模型,在此基础上设计实现融合投票和统一投影-邻居阈值思想的Motif发现并行算法.实验结果表明,给出的基于最优序列分配策略的Motif发现并行算法具有良好的加速和可扩展性,优于采用平均分配策略的Motif发现并行算法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟诚	广西大学计算机与电子信息学院	195	1023	14.0	21.0
2	李锦	广西大学计算机与电子信息学院	3	13	2.0	3.0