基于特征综合的启动子识别方法

• 作者: 刘咏梅 董宜堃
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 启动子 启动子识别 主成分分析 CpG岛 反向传播(BP)神经网络
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 图形、图像、模式识别
• 页码范围: 201-204
• 分类号: TP319.4
• 字数: 3342字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2012.11.043

摘要

针对真核生物启动子识别的高假阳性现状,提出了一种基于特征综合的真核启动子识别方法.通过提取人类启动子核苷酸联体统计信息作为特征,并使用主成分分析法进行主元提取.将10维主成分特征与2维CpG岛特征进行特征综合,共同作为BP神经网络的输入来识别启动子.对人类基因序列启动子的预测结果表明,不但有效地减小了假阳性,而且具有较好的敏感性和特异性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘咏梅	哈尔滨工程大学计算机科学与技术学院	29	108	6.0	7.0
2	董宜堃	哈尔滨工程大学计算机科学与技术学院	1	4	1.0	1.0