基于序列与结构域相似性的蛋白质直系同源聚类研究

• 作者: 任菲 张法 张阳德
• 来源期刊: 中国现代医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 结构域 同源直系 聚类 真核生物
• 年，卷（期）: 2012,（27）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 15-18
• 页数: 4页
• 分类号: R34|Q51
• 字数: 2831字
• 语种: 中文

摘要

目的 探讨直系同源蛋白质聚类分析的方法,为高效、快速的直系同源蛋白质聚类分析研究提供有效帮助.方法 基于蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,提出一种直系同源蛋白质聚类方法,实现了直系同源蛋白质的快速、精确聚类.结果 对人类、酵母、蠕虫、果蝇、拟南芥和斑马鱼等六种真核生物序列直系同源蛋白质的聚类分析,结果明显优于NCBI和TIGR的聚类结果.结论 利用蛋白质序列的相似性和结构域的相似性,可以有效筛选出假的同源关系,进而显著提高直系同源蛋白聚类的精确性和紧密性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张阳德	中南大学卫生部肝胆肠外科研究中心	556	4187	26.0	40.0
2	任菲	中南大学卫生部肝胆肠外科研究中心	3	4	2.0	2.0
3	张法	中国科学院计算技术研究所	15	156	5.0	12.0