基于OpenMP的Multi-Critical分子动力学并行算法优化

• 作者: 段振华 白明泽 豆育升
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 分子动力学 并行计算 多核处理器 开放式多处理 临界区
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 2432-2434
• 分类号: TP301.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2012.07.008

摘要

为提高分子动力学模拟在多核共享内存式服务器上的运算速度,在现有的分子动力学并行算法基础上提出了Multi-Critical算法.该算法使用手动划分力矩阵的方法,使多个线程进入不同名的临界区,并使用分块叠加的方法优化了并行算法,提高了并行效率.实验结果表明,对比之前的Critical算法,该算法的加速比和并行效率均有较大幅度的提高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白明泽	重庆邮电大学高性能计算与应用研究所	16	61	5.0	7.0
5	段振华	重庆邮电大学高性能计算与应用研究所	1	6	1.0	1.0