流形排序算法预测microRNA

• 作者: 刘兵强 刘文远 王宝文 王常武
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 微小RNA 加权图 置信传播 流形排序 预测 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 819-822
• 分类号: TP301.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2012.03.004

摘要

在已知microRNA (miRNA)较少的情况下,为了提高算法预测的准确性,提出一种基于流形排序的miRNA预测算法.该算法采用加权图模型描述序列,使用置信传播分配排序分数,降低了算法的时间复杂度；算法根据大规模数据内部全局流形结构进行排序,提高了排序结果的准确性.在人类和按蚊全基因组范围内的实验证明,流形排序算法的预测效果优于传统的预测方法,可以作为预测miRNA的一个有效工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王常武	燕山大学信息科学与工程学院	32	175	6.0	12.0
2	刘文远	燕山大学信息科学与工程学院	154	739	14.0	19.0
3	王宝文	燕山大学信息科学与工程学院	54	237	8.0	12.0
4	刘兵强	燕山大学信息科学与工程学院	1	4	1.0	1.0