结肠癌基因表达谱数据集噪声处理研究

• 作者: 张原 文天柱 易波
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 基因表达谱 噪声 小波变换
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 数据库、信号与信息处理
• 页码范围: 146-149
• 分类号: TP391
• 字数: 2775字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2012.10.032

摘要

针对较大规模结肠癌基因表达谱信息,对其噪声处理在基因标签提取问题中的作用进行了研究.不考虑噪声,用ReCorre算法确定分类基因,再用增l减r搜索算法确定基因标签组,对每个基因标签组使用基于支持向量机的留一交叉检验,确定最优的基因标签.分析噪声的影响,对于数据噪声,利用小波阈值去噪的方法滤除；对于无用基因,采用交替选择算法处理,进而重新确定基因标签.实验证明对肿瘤基因表达谱中噪声的处理有助于获取分类能力更好的基因标签.