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摘要:
以茎瘤芥幼苗叶片总RNA为模板,通过SMART RACE技术进行反转录和PCR扩增,克隆到瘤芥酸性核糖体蛋白P1 基因(命名为BjARPP1,GenBank登录号:JX282179),并利用ProtParam、DNAMAN等生物信息学工具对其核酸序列和蛋白序列进行分析.结果表明,茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因开放阅读框为342 bp,编码113个氨基酸,等电点为4.27,相对分子质量为11.25 ku:二级结构预测显示α-螺旋占53.98%、不规则卷曲占33.68%、延伸链占12.39%,还含有5个磷酸化位点;同源进化树预测分析其与拟南芥的同源性为96%,与其他物种同源性低.茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因为首次克隆,为进一步研究该基因的结构、功能、遗传变异规律以及其与生产性能的关系提供科学依据.
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文献信息
篇名 茎瘤芥酸性核糖体蛋白P1基因的克隆与序列分析
来源期刊 广东农业科学 学科 生物学
关键词 茎瘤芥 酸性核糖体蛋白P1基因 克隆 序列分析
年,卷(期) 2012,(19) 所属期刊栏目 生物技术
研究方向 页码范围 120-123
页数 4页 分类号 Q789
字数 3490字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 蔡应繁 重庆邮电大学生物信息学院 31 198 7.0 12.0
2 向浏欣 重庆邮电大学生物信息学院 20 45 3.0 5.0
3 付于银 重庆邮电大学生物信息学院 2 2 1.0 1.0
4 王秋娟 重庆邮电大学生物信息学院 1 0 0.0 0.0
5 冉燕子 重庆邮电大学生物信息学院 1 0 0.0 0.0
6 李露 重庆邮电大学生物信息学院 1 0 0.0 0.0
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研究主题发展历程
节点文献
茎瘤芥
酸性核糖体蛋白P1基因
克隆
序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广东农业科学
月刊
1004-874X
44-1267/S
大16开
广州市五山广东省农科院内
46-43
1965
chi
出版文献量(篇)
14242
总下载数(次)
17
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
重庆市自然科学基金
英文译名:
官方网址:http://law.ddvip.com/law/2006-09/11584979384040.html
项目类型:重点项目
学科类型:
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