利用计算方法识别定义内含子保留的基因组特征

• 作者: 汪洋 马猛
• 来源期刊: 计算机工程与应用
• 学科: 工学
• 关键词: 基因剪接 内含子保留 基因组特征
• 年，卷（期）: 2012,（28）
• 所属期刊栏目: 博士论坛
• 页码范围: 36-41
• 分类号: TP311
• 字数: 4566字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3778/j.issn.1002-8331.2012.28.008

摘要

超过90％的人基因都存在选择性剪接.正确识别不同的选择性剪接模式对深刻理解基因剪接调控机制具有重要意义.内含子保留是一种较为常见的基因剪接模式.从基因组序列本身出发,利用计算方法识别定义内含子保留的各种基因组特征,抽取统计意义上显著差异的特征,利用三种分类方法( SVM,NN,NB)对这些基因组特征进行了分类预测验证实验,保留内含子的平均预测精度达到70％,整体平均精度达到90％,取得了良好效果.研究方法也可应用于其他基因剪接模式的研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马猛	安徽大学计算机科学技术学院	15	44	4.0	6.0