单核细胞增生李斯特菌新疆野毒株XS5SigmaB操纵子的克隆、序列分析及其编码蛋白结构预测

• 作者: 乔军 孟庆玲 张再超 才学鹏 杨丽红 王为升 王俊伟 蔡扩军 陈创夫
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 单核细胞增生李斯特菌 SigmaB操纵子 序列分析 蛋白结构预测
• 年，卷（期）: 2012,（32）
• 所属期刊栏目: 兽医—应用研究
• 页码范围: 72-77
• 页数: 6页
• 分类号: S852.61
• 字数: 4493字
• 语种: 中文

摘要

为了解单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes LM.)新疆野毒株XS5 SigmaB操纵子的分子生物学特征.对LM-XS5的SigmaB操纵子部分基因序列进行了克隆与序列分析,预测该操纵子各基因编码蛋白质的二三级结构及功能活性位点,分析其同源性.结果表明:成功扩增出3000bp的SigmaB操纵子片段,序列分析显示该片段中包含RsbV、RsbW、RsbX和SigmaB4个基因,它们编码的蛋白质含有不同的功能活性位点,其中RsbV的5～102位AA为“STAS-抗-抗-SigamB因子”,RsbW的43～157位AA间为HATPase_c功能域,RsbX的32～198位AA间为PP2Cc超家族区域,SigmaB的8～264位AA为RNA聚合酶全酶中的SigmaB因子的区域.LM-XS5与其他3种革兰氏阳性菌的SigmaB基因的同源率在50％左右,与LM参考株的同源率在92.18％～100％之间.