黄瓜EST中SSR的分布特征分析

• 作者: 刘世强 段紫英 胡丽芳 蒋伦伟 黄长干
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 EST SSR
• 年，卷（期）: 2012,（22）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 160-162
• 页数: 3页
• 分类号: S642.2
• 字数: 2186字
• 语种: 中文

摘要

从葫芦科基因组数据库下载513 801条黄瓜EST,经EST-trimmer软件和CD-HIT程序预处理,共获得381 022条非冗余EST.利用Perl程序MISA搜索到SSR位点15 665个,检出率为4.11％.单、二和三核苷酸重复为主导类型,占EST-SSR总数的95.98％.A/T、AG/CT和AAG/CTT作为单、二和三核苷酸的优势重复基元,分别占EST-SSR总数的21.43％、15.68％和19.27％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄长干	江西农业大学理学院	45	554	11.0	22.0
2	刘世强	江西农业大学理学院	9	36	4.0	6.0
3	蒋伦伟	江西农业大学理学院	10	179	3.0	10.0
4	段紫英	江西农业大学理学院	3	7	1.0	2.0
5	胡丽芳	江西农业大学农学院作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室	7	24	3.0	4.0