巴西橡胶树膜结合NAC转录因子HbNTL1的克隆及生物信息学分析

• 作者: 代龙军 康桂娟 曾日中 段翠芳 聂智毅 黎瑜
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 巴西橡胶树 膜结合NAC转录因子 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（31）
• 所属期刊栏目: 林学—研究报告
• 页码范围: 7-14
• 页数: 8页
• 分类号: S3
• 字数: 4634字
• 语种: 中文

摘要

根据巴西橡胶树胶乳cDNA文库中筛选到的NAC EST序列,克隆了橡胶树膜结合NAC转录因子,HbNTL1的cDNA和基因组DNA序列.生物信息学分析显示HbNTL1基因包含6个外显子和5个内含子,开放阅读框(ORF)为1704 bp,编码了567个氨基酸.HbNTL1编码蛋白的相对分子量为62.52 kDa,理论等电点PI为4.62,N-端具有保守的NAC结构域,高度变异的C-端有一个跨膜结构域(TM).序列比对和系统进化分析表明,HbNTL1蛋白属于NAC转录因子家族中的NAC2亚族,推测其可能与橡胶树生长发育和胁迫应答有关.