人参属植物鲨烯合酶编码基因及其氨基酸序列的生物信息学分析

• 作者: 支伟特 毛乐心 缪康汝 赵昶灵 陈中坚 陈文龙
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 人参属 鲨烯合酶 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（31）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 220-226
• 页数: 7页
• 分类号: Q71
• 字数: 3934字
• 语种: 中文

摘要

利用生物信息学方法对GenBank中人参属9种植物鲨烯合酶的cDNA序列以及其编码的氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性、亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域功能域和进化关系进行了初步预测和分析.结果表明:总体上人参属鲨烯合酶核苷酸序列相似性平均为96.245％,氨基酸相似性平均为95.5％.其二级结构预测结果显示9个鲨烯合酶氨基酸序列以α螺旋和无规则卷曲为主要组成部分.对9种人参属植物进行进化树分析发现可以分为2个亚族.对包括人参属9种植物在内的其他物种进行进化树分析可知,植物、动物、酵母分属不同的类群.通过分析人参属植物鲨烯合酶及其编码基因的生物信息学特征,可以为鲨烯合酶基因的克隆和遗传操作提供理论参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵昶灵	云南农业大学农学与生物技术学院	89	968	17.0	27.0
2	陈中坚		8	105	6.0	8.0
3	毛乐心	云南农业大学农学与生物技术学院	2	21	2.0	2.0
4	支伟特	云南农业大学农学与生物技术学院	3	44	3.0	3.0
5	陈文龙	云南农业大学农学与生物技术学院	3	44	3.0	3.0
6	缪康汝		3	44	3.0	3.0