恶疫霉实时定量RT-PCR分析中内参基因的选择

• 作者: 张博月 徐敬友 童蕴慧 邢玉平 陈孝仁
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 内参基因 持家基因 恶疫霉 实时定量RT-PCR 草莓
• 年，卷（期）: 2012,（30）
• 所属期刊栏目: 生物技术—研究报告
• 页码范围: 201-207
• 页数: 7页
• 分类号: S432.4+4
• 字数: 5928字
• 语种: 中文

摘要

为选择合适的内参基因用于分析植物病原卵菌恶疫霉(Phytophthora cactorum)的基因表达情况,本研究利用实时定量RT-PCR分析持家基因Ubc、Tub-b、WS21和WS41在恶疫霉生长发育阶段和侵染草莓阶段的表达差异,并利用软件geNorm、NormFinder和BestKeeper比较其表达稳定性.结果表明:基于公共数据库序列和其他疫霉菌同源序列设计的持家基因引物在恶疫霉中具有良好的扩增效率、反应有效性和特异性.通过分析,发现在恶疫霉的不同生长发育阶段(菌丝生长、游动孢子囊、游动孢子和休止孢萌发)和侵染草莓阶段(接种后3、5、7天),表现最为稳定的是Ubc基因.当使用多个内参基因时,Ubc和WS41是最适合校正恶疫霉基因表达数据的内参基因组合.本研究结果为利用实时定量RT-PCR准确分析恶疫霉基因相对表达量提供了重要的内参基因,也为其他疫霉菌的基因表达研究提供了有价值的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张博月	扬州大学园艺与植物保护学院	2	6	2.0	2.0
2	童蕴慧	扬州大学园艺与植物保护学院	82	1786	23.0	41.0
3	徐敬友	扬州大学园艺与植物保护学院	80	1869	25.0	42.0
4	陈孝仁	扬州大学园艺与植物保护学院	22	70	4.0	7.0
5	邢玉平	扬州大学园艺与植物保护学院	4	11	2.0	3.0