利用Solexa测序技术发掘木薯microRNAs

• 作者: 卢诚 张何芳 王文泉 章伟雄 陈新
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 木薯 miRNA Solexa测序
• 年，卷（期）: 2012,（30）
• 所属期刊栏目: 生物技术—研究报告
• 页码范围: 184-190
• 页数: 7页
• 分类号: Q-3
• 字数: 3375字
• 语种: 中文

摘要

为了发掘木薯中的microRNAs (miRNAs),了解其在木薯中的调控机制,利用Solexa测序技术在木薯中发现了大量的miRNAs,并利用一种新的miRNA定量检测技术(Multiplexed RT法)对其进行实验验证.通过对构建的3个小RNA文库进行Solexa测序与生物信息学分析,最终获得19个家族93个保守的miRNA和74个新的miRNA,实验验证了测序获得的83个miRNA.在Arg7块根中特异表达的有6个miRNA,分别为miR172d、miR396c、miR398a、miR398b、miR399e、miR399f,叶片中特异表达的有13个,须根中特异表达的有3个,这些miRNAs将为深入了解木薯块根发育和淀粉累积机理提供了一个新的视角.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢诚	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	31	232	8.0	13.0
2	王文泉	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	74	886	18.0	26.0
3	陈新	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	25	250	9.0	15.0
4	张何芳		1	4	1.0	1.0
8	章伟雄	中国热带农业科学院热带生物技术研究所	1	4	1.0	1.0