罂粟BBE基因的生物信息学分析

• 作者: 李萍 赵启明 陈大志
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: BBE基因 生物信息学 吗啡 小檗碱
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 225-229
• 分类号: Q943.2
• 字数: 1858字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.10.043

摘要

为了对罂粟BBE基因核酸及编码的蛋白质的性质进行预测分析,并构建罂粟BBE基因的三维结构模型.运用生物信息学方法对罂粟BBE基因的理化性质、亲/疏水性、信号肽、亚细胞定位、二级结构等进行预测,同时采用同源建模的方法对罂粟BBE基因的三维结构进行模拟,并将得到的模型用能量最小化原则优化,最后用Ramachandran Plot对模型进行评估.结果表明:罂粟BBE基因全长为5073bp,编码一段长为535个氨基酸的蛋白质.BBE为富含Gly、Ser和Leu的酸性稳定类亲水蛋白,定位于液泡中,N-末端含有23个氨基酸的信号肽,α螺旋和无规则卷曲是罂粟BBE的主要二级结构元件.通过同源建模获得了合理的罂粟BBE三维结构模型.本研究为采用生物工程技术提高小檗碱的含量、开发小檗碱类抗茵药物奠定理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵启明	西南交通大学生命科学与工程学院	4	70	2.0	4.0
2	陈大志	西南交通大学生命科学与工程学院	5	19	2.0	4.0
3	李萍	西南交通大学生命科学与工程学院	44	282	7.0	15.0