动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3的生物信息学分析

• 作者: 丁彪 刘勇 吴风瑞 尚明保 李文雍 杨旬旬
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 组蛋白甲基化酶 MLL3 SET结构域 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 3884-3888
• 分类号: Q512+.7
• 字数: 3329字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2012.07.020

摘要

[目的]对动物组蛋白H3K4三甲基化转移酶MLL3进行生物信息学分析.[方法]利用生物信息学的方法,对小鼠MLL3的基因结构、氨基酸序列、系统进化树、染色体定位和共线性等问题进行分析.[结果]编码合成的小鼠MLL3蛋白质一级结构包括7个锌指结构域、1个HMG-box(高迁移率族蛋白)、1个FYRN(N-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个FYRC(C-末端富含苯丙氨酸或酪氨酸区域)、1个SET域和1个postSET域；从序列对比和同源性上发现,该研究中的19种动物都基本上具有这些结构,说明这些结构在进化上是相对保守的,其中SET域具有高度的保守性,是维持组蛋白甲基化酶活性所必须的；从系统发生上看,19种动物在进化树上的位置与其分类地位相一致；在共线性分析中,虽然小鼠和人的MLL3基因位于不同的染色体上,但其上游和下游具有相同的基因,说明小鼠和人的MLL3基因具有共线性.[结论]不仅揭示了MLL3的核苷酸序列及其氨基酸序列的一级结构,为以后研究其高级结构和蛋白质的功能奠定了基础；同时也为后期进行小鼠MLL3基因的引物设计、启动子分析、基因的克隆、定位和表达的调控模式研究奠定了基础.