白菜SAUR基因家族的生物信息学分析

• 作者: 张涛 李荣冲 梁晶龙 王瑞雪 赵敬会
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 生物学
• 关键词: 白菜 生长素 SAUR 基因重复
• 年，卷（期）: 2012,（22）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 130-137
• 分类号: Q74
• 字数: 3755字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.22.023

摘要

旨在为今后开展白菜SAUR基因家族的功能奠定基础.本研究利用生物信息学的方法对白菜生长素早期应答基因SAUR(Small auxin-up RNA)家族的保守基序、氨基酸等电点、分子进化以及表达模式等基本性质进行了分析.结果表明,白菜143个SAUR蛋白质中,有111个蛋白质偏碱性,31个偏酸性,有1个呈中性；从对该基因家族构建的进化树中可以看出它分化出2个大的亚家族,其中一个亚家族还处在不断分化中；此外,找到61个SAUR基因的EST表达证据,且基因表达部位比较丰富.通过研究分析表明本研究可以得出结论基因重复是白菜SAUR基因家族的一大特点,143个基因中含有51个同源对.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张涛	重庆师范大学生命科学学院	50	315	10.0	16.0
2	王瑞雪	重庆师范大学生命科学学院	8	77	6.0	8.0
3	赵敬会	重庆师范大学生命科学学院	5	34	3.0	5.0
4	李荣冲	重庆师范大学生命科学学院	6	40	4.0	6.0
5	梁晶龙	重庆师范大学生命科学学院	3	30	3.0	3.0