虹鳟Hepcidin cDNA的克隆及序列分析

• 作者: 侯莉 姜娜 李铁梁 罗琳 邢薇 马志宏
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 虹鳟 抗菌肽 Hepcidin cDNA克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（20）
• 所属期刊栏目: 水产-应用研究
• 页码范围: 148-153
• 分类号: S9
• 字数: 4055字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.20.028

摘要

为了从虹鳟肝脏中扩增出Hepcidinc全长DNA序列,预测出氨基酸序列,并进行序列分析.通过RT-PCR和RACE PCR的方法,从虹鳟肝脏中克隆获得了Hepcidin全长cDNA序列,利用在线工具和软件包分析.结果表明:虹鳟Hepcidin全长cDNA序列(GenBank登录号HQ71 1993)为883 bp,5’端非翻译区211bp,3’端非翻译区为405 bp,以及一段267 bp的编码序列,编码88个氨基酸,由信号肽(24个氨基酸)、原肽(39个氨基酸)和成熟肽(25个氨基酸)组成,成熟肽C端含有Hepcidin类抗菌肽的8个半胱氨酸保守性结构,可形成4个分子内二硫键.与已报道的鲑形目大西洋鲑Hepcidin氨基酸序列的一致性为93％,与其他鱼类Hepcidin氨基酸序列的一致性为44％～88％,是Hepcidin家族的新成员.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姜娜	北京市农林科学院北京市水产科学研究所	6	27	3.0	5.0
2	马志宏	北京市农林科学院北京市水产科学研究所	7	102	3.0	7.0
3	侯莉		1	1	1.0	1.0
4	邢薇	北京市农林科学院北京市水产科学研究所	5	20	2.0	4.0
5	李铁梁	北京市农林科学院北京市水产科学研究所	6	95	3.0	6.0
6	罗琳	北京市农林科学院北京市水产科学研究所	7	102	3.0	7.0