大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV)EST-SSR信息分析与引物筛选

• 作者: 宋希云 张志刚 张晓亮 李巧云 赵智中
• 来源期刊: 中国农学通报
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 芜菁花叶病毒 EST-SSR
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 园艺—研究报告
• 页码范围: 121-126
• 分类号: S634.1
• 字数: 3265字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6850.2012.10.022

摘要

为了研究大白菜抗芜菁花叶病毒(TuMV),对大白菜及芸薹属中与抗性有关的EST序列进行了搜索和SSR筛选,并根据SSR两端的序列设计引物,以1对大白菜TuMV抗、感材料的基因组DNA为模板,对上述引物进行了筛选.结果表明,在132条大白菜EST和895条芸薹属抗性EST序列中,共筛选出166个符合条件的SSR(16.2％).其中包含6种核苷酸重复基元,占主导地位的分别是二核苷酸重复(33.7％)和三核苷酸重复(50.0％),其余重复类型所占比例较小.根据上述SSR两翼的序列,共设计引物196对.引物筛选结果表明,能够进行成功扩增的有156对,占79.6％,其中35对引物在2份材料中具有多态性.因此,利用芸薹属中抗性有关的EST序列设计SSR引物,可用于大白菜TuMV抗性有关基因的标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	宋希云	青岛农业大学生命科学学院	79	363	11.0	14.0
2	张晓亮	青岛农业大学生命科学学院	2	6	2.0	2.0