东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及多样性分析

• 作者: 万勇 戴亮芳 曹娟芳 罗向东 胡标林 谢建坤 邓晓娟
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 东乡野生稻 渐渗系 SSR分析 基因组结构变化 遗传变异
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1336-1339
• 分类号: S511.9
• 字数: 3837字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2012.03.026

摘要

[目的]研究东乡野生稻渐渗系基因组结构变化及对其进行多样性分析.[方法]以东乡野生稻(O.rufipogon Grif,供体)和栽培稻协青早B(O.sativa sp.indica Kato.,受体)构建的BC1F6渐渗群体为研究材料,利用筛选出的分布在12对染色体上的25对SSR引物对群体中的239个株系进行多态性分析.[结果]25个微卫星位点都有东乡野生稻DNA片段不同程度的渗入,群体均大部分保留亲本协青早B或东乡野生稻的DNA序列.渐渗系基因组中平均受体纯合条带百分率为78.13％,最高达94.98％(引物为RM131),最低为60.25％(引物为RM171).平均供体纯合条带百分率为13.37％,最高达32.64％(引物为RM171),最低为2.93％( RM1095).群体中还存在一些杂合位点,平均杂合率为5.62％,最高达10.04％(引物为RM401).此外,BC1F6渐渗群体中发现有双亲条带的丢失和一些双亲所没有的新条带出现,其中平均亲本条带丢失率为2.88％,最高达13.39％(引物为RM311),最低为0(引物为RM401),平均新带率为1％.高世代渐渗群体平均Nei's基因多样性(He)和平均Shannon's信息多样性指数(Ⅰ)分别为0.276和0.457.[结论]通过远缘杂交,渐渗系发生了广泛遗传与表观遗传变异,扩大了遗传变异基础,为水稻品种改良与种质创新奠定了重要基础.