梨苯丙氨酸解氨酶基因的生物信息学分析

• 作者: 于凤鸣 张立彬 李义红
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 梨 苯丙氨酸解氨酶 生物信息学
• 年，卷（期）: 2012,（32）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 15569-15574,15580
• 页数: 7页
• 分类号: S661.2
• 字数: 3525字
• 语种: 中文

摘要

[目的]对梨苯丙氨酸解氨酶(PAL)的基因进行生物信息学分析.[方法]以梨的苯丙氨酸解氨酶基因为研究对象,运用生物信息学方法对其编码的蛋白质结构、理化性质及功能结构域进行分析.[结果]梨pal基因的全长编码区序列(Coding sequences,CDS)长2 160 bp,编码720个氨基酸；序列比对结果显示,梨的pal基因与葡萄、树莓、甜樱桃、烟草、毛果杨、柠檬、水稻pal基因的同源性分别为86％、90％、94％、85％、88％、88％和73％；系统进化分析结果显示,梨pal基因与甜樱桃的进化关系最为密切；梨苯丙氨酸解氨酶定位于细胞基质,二级结构以随机卷曲和α-螺旋为主要构件,三维建模成功.[结论]为今后研究PAL和梨木质素合成的分子机理提供了一定的理论参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张立彬		73	320	8.0	15.0
2	于凤鸣		43	349	11.0	16.0
3	李义红		1	5	1.0	1.0