基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取       
摘要:
目的:识别肺癌疾病相关功能模块,对了解肺癌疾病的发病机制至关重要。方法:本文提出一个挖掘疾病相关功能模块的整合方法。采用包括正常和肺癌样本的微阵列数据,首先,应用rank-based方法构建基因共表达网络;其次,通过Qcut挖掘基因共表达模块;然后基于肺癌差异表达基因及基因模块功能一致性的联合测度,最终筛选出疾病相关功能模块。结果:研究发现,我们的方法获得7个显著疾病相关功能模块,经文献证实都与肺癌的发生发展有着密切的联系。进一步分析发现不仅能获得与传统方法功能一致的模块,而且还发现了传统方法没有获得的病毒层面的两个模块(模块351和352)。结论:我们的方法能够有效地发现新的功能模块,为探索癌症致病机理提供新的视角及依据。
推荐文章
基于WGCNA的马铃薯根系抗旱相关共表达模块鉴定和核心基因发掘
马铃薯
干旱胁迫
权重基因共表达网络
转录组学
利用WGCNA鉴定棉花抗黄萎病相关基因共表达网络
棉花
黄萎病
加权基因共表达网络分析
核心基因
利用WGCNA进行玉米花期基因共表达模块鉴定
玉米
权重基因共表达网络
发育调控
开花
转录组
利用WGCNA鉴定非生物胁迫相关基因共表达网络
水稻
干旱胁迫
冷胁迫
盐胁迫
权重基因共表达网络(WGCNA)
内容分析
关键词云
关键词热度
相关文献总数  
(/次)
(/年)
文献信息
篇名 基于共表达网络挖掘肺癌相关模块
来源期刊 生物物理学 学科 医学
关键词 共表达网络 基因表达 模块挖掘 肺癌
年,卷(期) swwlx_2013,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 17-24
页数 8页 分类号 R73
字数 语种
DOI
五维指标
传播情况
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献  (0)
共引文献  (0)
参考文献  (0)
节点文献
引证文献  (0)
同被引文献  (0)
二级引证文献  (0)
2013(0)
  • 参考文献(0)
  • 二级参考文献(0)
  • 引证文献(0)
  • 二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
共表达网络
基因表达
模块挖掘
肺癌
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生物物理学
季刊
2330-1686
武汉市江夏区汤逊湖北路38号光谷总部空间
出版文献量(篇)
48
总下载数(次)
51
论文1v1指导