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摘要:
应用全基因组DNA甲基化芯片(Illumina Infinium HumanMethylation27 BeadChip)杂交技术以及转录组RNA测序技术,检测了雄激素依赖性前列腺癌(androgen-dependent prostate cancer,ADPC)细胞株LNCaP和雄激素非依赖性前列腺癌(androgen-independent prostate cancer,AIPC)细胞株LNCaP-AI(androgen independent)中的差异甲基化基因.发现与LNCaP细胞株相比,LNCaP-AI细胞株有990个CpG位点表现为高甲基化,涉及855个基因;2 305个CpG位点表现为低甲基化,涉及1 970个基因.结合转录组mRNA表达结果,筛选出6个超甲基化基因:FAM111B、RAB36、PCDH7、COL6A2、IGF1R、GULP1; 8个低甲基化基因:EPHA3、TM4SF1、IGFBP5、FAM1 05A、RASD4、ITPR2、CYP27B1、UBE2E3.这些差异甲基化基因涉及钙离子信号通路、Wnt信号通路等多个信号通路,参与了细胞的基因表达、信号传导、细胞通讯、细胞运动、细胞黏附以及血管生成等功能,为探讨这些差异甲基化基因在前列腺癌雄激素非依赖性转化过程中发挥的作用奠定了基础.
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关键词云
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文献信息
篇名 雄激素非依赖性前列腺癌细胞中差异甲基化基因的初步筛选
来源期刊 中国细胞生物学学报 学科
关键词 雄激素非依赖性前列腺癌 DNA甲基化 DNA甲基化芯片 转录组测序
年,卷(期) 2013,(1) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 24-29
页数 6页 分类号
字数 语种 中文
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研究主题发展历程
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雄激素非依赖性前列腺癌
DNA甲基化
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转录组测序
研究起点
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期刊影响力
中国细胞生物学学报
月刊
1674-7666
31-2035/Q
大16开
上海岳阳路319号31B楼408室
4-296
1979
chi
出版文献量(篇)
3930
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24
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21449
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浙江省自然科学基金
英文译名:
官方网址:http://www.zjnsf.net/
项目类型:一般项目
学科类型:
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