五种啮齿类动物mtDNA蛋白编码基因序列变化的比较

• 作者: 宋国华 岳文斌 庞文彪 陈朝阳
• 来源期刊: 中国实验动物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 啮齿类 线粒体DNA 蛋白编码基因 变异 分子进化
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 70-74
• 页数: 5页
• 分类号: Q95-33
• 字数: 3559字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-4847.2013.01.014

摘要

目的 利用本实验室测定的中国地鼠、金黄地鼠和GenBank中田鼠、小鼠、大鼠的线粒体全基因组序列,比较分析五种啮齿类动物的mtDNA蛋白编码基因序列的变异,探讨其分子进化关系.方法 将五种动物各自的13个蛋白编码基因分别连接成一个序列,用DNAstar-EditSeq分析软件计算每个序列的碱基长度和组成,计算蛋白编码基因的碱基和氨基酸的差异.以人为外群,基于连接在一起的13个蛋白编码基因的氨基酸序列,用MEGA4.0软件通过最大简约性法(MP)和非加权成对平均数法(UPGMA)构建进化树.结果在五种啮齿动物的13个蛋白基因序列中,A、T、C、G碱基的平均含量为32.4 %、29.6 %、26.2 %和11.9 %,中国地鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列与其他物种相比,与金黄地鼠的相应序列差异最小,与大鼠mtDNA各蛋白编码序列以及其编码的氨基酸序列差异较大.分子进化树也显示中国地鼠和金黄地鼠的亲缘关系最近,与小鼠、大鼠存在的差异相对大.结论 五种动物的碱基组成的百分比中显示G的相对缺乏,相互之间的进化关系与传统的分类地位基本吻合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳文斌	山西农业大学动物科技学院	221	1586	19.0	30.0
2	宋国华	山西医科大学实验动物中心	60	345	9.0	15.0
3	陈朝阳	山西医科大学实验动物中心	30	203	9.0	13.0
4	庞文彪	山西医科大学实验动物中心	10	29	4.0	5.0