新德里金属β-内酰胺酶基因序列比对与蛋白分子结构

• 作者: 张德纯 张玲 胡晓武 贺松
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 新德里金属β-内酰胺酶 同源性 序列比对
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 289-292
• 分类号: R387|Q78
• 语种: 中文

摘要

目的 分析不同来源细菌新德里金属β-内酰胺酶(NDM)编码基因序列的相似性和同源性,并分析其蛋白分子结构.方法 在GenBank中检索目前已经注册的NDM编码基因序列88个(包括NDM-1～ NDM-6),利用ClustalW2生物软件在线分析NDM基因序列的相似性和同源性,建立基因进化树,分析编码基因序列的特点；利用ESyPred3D软件构建三维结构图,并用Molsoft ICM-Pro软件进行编辑处理.结果 88个NDM编码基因是完全一致的长度为813 bp的基因序列,具有很高的同源性；NDM蛋白由270个氨基酸组成并借助Zn2+和枸橼酸维持其分子空间结构.结论 NDM编码基因具有很高的同源性,本研究成功构建了NDM的三维结构图,为NDM宿主菌基于NDM核酸序列的分子生物学快速检测和其对各种抗生素产生耐药的机制研究奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张德纯	重庆医科大学病原生物学教研室	86	640	15.0	20.0
2	胡晓武		9	24	3.0	4.0
3	贺松		2	2	1.0	1.0
4	张玲		2	1	1.0	1.0