贵州省2011年急性胃肠炎诺如病毒的哨点监测及其基因特征分析

• 作者: 吴悦 王定明 田克诚 郭军 阎岩
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 医学
• 关键词: 诺如病毒 GⅡ4型 GⅡ3型 VP1基因 贵州
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 51-55
• 页数: 5页
• 分类号: R373.2
• 语种: 中文

摘要

为了解贵州省2011年诺如病毒的基因型,监测了2011年5月至12月于贵州省人民医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Real-time RT-PCR)初步鉴定,并对阳性株的VP1基因区克隆及测序.检测标本70份,GⅠ型诺如病毒阳性1株,阳性率1.43％,GⅡ型诺如病毒阳性34株,阳性率48.57％,获得7份GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,3株为GⅡ.4亚型,为新型变异株(GⅡ4 2011),与GⅡ4 2006b变异株的亲缘关系最近,有1个氨基酸位发生了回复突变；4株为GⅡ.3亚型,分为2个基因簇,1簇与2008～2009年韩国株(HM635118)及上海株(GU991355)的亲缘关系最近,1簇与2010年日本株(AB629943)及2007年印度株(EU921389)等的亲缘关系最近,有4个氨基酸位点易发生回复突变.