H1N1猪流感病毒广西分离株HA基因序列分析

• 作者: 何奇松 孙翔翔 徐贤坤 李春英 梁丹洁 熊毅 胡巧云 颜健华
• 来源期刊: 南方农业学报
• 关键词: 猪流感病毒 甲型H1N1流感病毒 HA基因 序列分析 同源性
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 畜牧·兽医·水产·蚕桑
• 页码范围: 1196-1200
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j:issn.2095-1191.2013.7.1196

摘要

[目的]了解H1N1猪流感病毒广西分离株的分子特征,为广西猪流感疫情监控提供参考依据.[方法]采用RT-PCR对2011年分离获得的H1N1猪流感病毒广西分离株(A/swine/Guangxi/1/2011)的HA基因进行扩增,然后利用DNASTAR分析软件对测序基因片段进行整个阅读框架的核苷酸序列及其推导氨基酸序列同源性比对分析,并用MEGA 4.0绘制遗传进化树.[结果]广西分离株HA基因长1701 bp,编码566个氨基酸,核苷酸序列与经典SIV的同源性为88.0％～99.6％,与季节性H1N1人流感病毒的同源性为76.3％～77.3％,与欧洲类禽SⅣ分离株的同源性为72.9％～75.4％,与2009甲型H1N1流感病毒的同源性为99.2％～99.6％；从核苷酸遗传进化树可知,广西分离株与类禽H1N1流感病毒和人H1N1流感病毒分离株的亲缘关系较远,而与2009甲型H 1N l流感病毒分离株的亲缘关系最近.广西分离毒株HA基因的裂解位点序列为IPSIQSR↓G,具有典型低致病性流感病毒的分子生物学特征；共有8个糖基化位点,其中6个位于HAl区,两个位于HA2区；广西分离株HA蛋白RBS位点的氨基酸同时具有人和猪流感病毒的特点.[结论]广西分离株(A/swine/Guangxi/1/2011)属于2009甲型H1N1流感病毒.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐贤坤		13	66	5.0	7.0
2	熊毅		29	113	6.0	8.0
3	孙翔翔	广西大学动物科技学院	8	25	4.0	4.0
4	何奇松	广西大学动物科技学院	4	18	3.0	4.0
5	胡巧云		3	12	3.0	3.0
6	颜健华	广西大学动物科技学院	2	12	2.0	2.0
7	李春英	广西大学动物科技学院	4	7	2.0	2.0
8	梁丹洁	广西大学动物科技学院	3	4	1.0	2.0