苎麻 WRKY 转录因子的序列分析

• 作者: 付莉莉 刘头明 唐守伟 朱四元 汤清明
• 来源期刊: 中国麻业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 苎麻 WRKY转录因子 序列聚类分析 进化树分析
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 113-117
• 页数: 5页
• 分类号: S563.1
• 字数: 2203字
• 语种: 中文

摘要

本研究通过分析苎麻转录组中的基因注释，首次筛选出8个苎麻WRKY转录因子基因序列。结合拟南芥、水稻、大豆和小麦等作物的10个已报道具有抗旱功能的WRKY转录因子序列进行聚类分析，发现这10个具有抗旱功能的WRKY基因和苎麻的8个WRKY基因的蛋白质编码序列高度保守。利用MEGA软件进一步构建这18个WRKY基因的蛋白质序列进化树，结果发现18个WRKY转录因子可以分为4组，其中Unigene5705与CL3777.Contig1和大豆的Gm-WRKY13同属一组，即WRKY－1类；而Unigene5211 CL5210.Contig1， Unigene14199和拟南芥的AtWRKY2同属WRKY－2类；两个苎麻WRKY基因（ Unigene22787和Unigene29108）则和六个已报道的抗旱WRKY基因（ AtWRKY57， OsWRKY08， OsWRKY11， OsWRKY72， GmWRKY21和GmWRKY54）同属 WRKY －3类； CL34.Contig1， TcWRKY53和 ABO3/AtWRKY63同属WRKY－4组。由于所有10个拟南芥、水稻、大豆和小麦WRKY基因具有抗旱功能，因此我们推测苎麻的这8个WRKY转录因子很可能也具有抗旱调控功能。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤清明	中国农业科学院麻类研究所	42	263	8.0	14.0
2	唐守伟	中国农业科学院麻类研究所	74	636	15.0	21.0
3	朱四元	中国农业科学院麻类研究所	34	161	7.0	10.0
4	刘头明	中国农业科学院麻类研究所	24	77	5.0	6.0
5	付莉莉	中国农业科学院麻类研究所	2	7	2.0	2.0