三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析

• 作者: 何建 关斌 刘建军 李洪雯 王建辉 陈克玲
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄卷叶伴随2型病毒 葡萄B病毒 葡萄A病毒 病毒外壳蛋白基因 病毒沉默抑制子基因
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 197-201
• 页数: 5页
• 分类号: S663.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,[方法]比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法.分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析.[结果]结果表明,改进硅胶颗粒吸附法快速从葡萄枝条的韧皮组织中提取了总RNA,并以葡萄18SRNA为内参基因,RT-PCR分别成功扩增出3种病毒的目的片段.把16个地理起源的GLRaV-2分离株的外壳蛋白基因(Coat protein,CP)分成5个系统进化组.而7个地理起源的GVB分离株CP同源性为79.1％～98.7％.此外,5个GVA四川分离株分别位于系统进化树的4个聚类群.[结论]GLRaV-2、GVB和GVA不同地理起源的分离株在核酸水平上具有变异性,其中GVA四川分离株之间具有显著的遗传差异,可能包括4种株系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李洪雯		32	169	8.0	12.0
2	刘建军		35	185	8.0	12.0
3	王建辉		13	83	5.0	9.0
4	何建		17	107	7.0	10.0
5	陈克玲		28	191	9.0	13.0
6	关斌		10	54	4.0	7.0