摘要:
[目的]从基因组序列角度进一步揭示自然界斜纹夜蛾核型多角体病毒(Spodoptera litura nucleopolyhedrovirus,SpltNPV)的基因型多态性.[方法]病毒克隆A5,F1,X3和X15分别以活体克隆法分离自SpltNPV埃及株、日本福冈株和日本小笠原株.根据SpltNPV基因组全序列(GenBank登录号:AF325155)和海灰翅夜蛾核型多角体病毒(S.littoralis NPV,SpliNPV)部分基因序列(GenBank登录号:X99377,X99376和X98924)设计引物,PCR扩增获得A5,F1,X3和X15的多角体蛋白(polyhedrin,polh)基因和ORF18~ ORF23序列.[结果]根据多角体蛋白基因序列,X3和X15属于SpltNPV型,而A5和F1属于SpliNPV型.将A5,F1,X3和X15的ORF18 ~ORF23与SpltNPV和SpliNPV相应的基因序列进行同源性比较.结果发现,F1与SpliNPV以及X3与SpltNPV的核苷酸序列相似性高,但X3的ORF20在172 ~ 558 nt处缺失387 bp.尽管依据多角体蛋白基因序列X15属于SpltNPV型,但对于ORF18 ~ ORF23序列,X15与SpliNPV的相似性高于与SpltNPV的相似性.同样,A5属于SpliNPV型,ORF18 ~ ORF20与SpliNPV相应的核苷酸序列相似性高,但ORF21与SpltNPV相应的核苷酸序列一致性为100%,特别是ORF22,SpltNPV的特有序列出现在A5的基因组中,而且与SpltNPV的ORF22一致性为100%;反过来,ORF23又与SpliNPV相应的核苷酸序列相似性高.[结论]所有这些都表明,SpltNPV在自然界不仅存在基因型多态性,而且即使属于同一基因型,它们的基因组序列也有显著差异.可利用SpltNPV在自然界的这种异质性筛选适宜防治斜纹夜蛾幼虫的株系.