陆地棉水通道蛋白GhNIP6.1基因的克隆及表达分析

• 作者: 倪万潮 巩元勇 束红梅 郭书巧
• 来源期刊: 棉花学报
• 学科: 农学
• 关键词: 陆地棉 水通道蛋白 GhNIP6.1 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究与进展
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S562.035.3
• 字数: 5947字
• 语种: 中文

摘要

根据EST拼接的序列设计引物,利用RT-PCR技术,从陆地棉品种苏棉18中克隆获得了一个水通道蛋白基因GhNIP6.1.该基因开放阅读框包含903个核苷酸,编码300个氨基酸,分子量为30.97 kD,理论等电点为8.99.GhNIP6.1蛋白的生物信息学分析表明:GhNIP6.1含有6个跨膜区,由5个环相连,其中环A、C和E在细胞膜外,环B、D和蛋白的N、C末端都位于细胞膜内,N末端79个氨基酸,C末端18个氨基酸,具有MIP家族典型的保守氨基酸序列；该蛋白的三级结构同拟南芥的AtNIP6.1非常相似,亚细胞定位也同AtNIP6.1一致,可能位于质膜中.进化分析发现,GhNIP6.1蛋白同拟南芥的AtNIP6.1蛋白相似性最高.进一步扩增棉花核基因组获得了2021bp的DNA序列,它包含5个外显子和4个内含子,所有外显子/内含子交接点都遵从gt/ag剪接规则.半定量分析表明,该基因在根、茎和叶中都有表达,其中真叶含量较高,子叶中没有表达.