基于线粒体D-loop基因序列研究我国5种虾虎鱼类的系统进化关系

• 作者: 侯新远 尹绍武 张丽娟 张国松 李丽 汪亚媛 祝斐 胡亚丽 贾一何
• 来源期刊: 海洋渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 虾虎鱼类 D-loop 系统进化
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: Q731
• 字数: 4739字
• 语种: 中文

摘要

利用PCR技术扩增河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)、鸭绿沙塘鳢(Odontobutis yaluensis)、中华沙塘鳢(Odontobutis sinensis)、葛氏鲈塘鳢(Perccottus glenii)及尖头塘鳢(Eleotris oxycephala)的线粒体D-loop区并测序,获得河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、中华沙塘鳢、葛氏鲈塘鳢及尖头塘鳢线粒体D-loop区全序列分别为853 bp、853 bp、1 028 bp、852 bp、848 bp,结合GenBank中平头沙塘鳢(Odontobutis platycephala)、刺盖塘鳢(Eleotris acanthopoma)、黑体塘鳢(Eleotris melanosoma)、褐塘鳢(Eleotris fusca)、中华乌塘鳢(Bostrychus sinensis、云斑尖塘鳢(Oxyeleotris marmorata)、溪鳢(Rhyacichthys aspro))等7种虾虎鱼类同源的D-loop区序列,分析了这12种虾虎鱼类的系统发育关系.所使用的同源序列长度为832 ～846 bp,其中保守位点452个,变异位点405个,简约信息位点258个,单态位点145个,转换/颠换平均值为0.8.基于Kimura 2-parameter模型的12种虾虎鱼类遗传距离范围为0.043～0.312,在Kimura 2-parameter模型构建的邻接树和非加权配对法系统树中,河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、中华沙塘鳢、平头沙塘鳢聚为一大支,刺盖塘鳢、黑体塘鳢、褐塘鳢、尖头塘鳢、溪鳢、葛氏鲈塘鳢聚为另一支.