番鸭小鹅瘟弱毒D株NS蛋白抗原位点特征分析

• 作者: 朱小丽 李兆龙 林锋强 王劭 程晓霞 陈仕龙 陈少莺
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番鸭小鹅瘟病毒 NS蛋白 抗原表位 分子特征
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 301-308
• 页数: 8页
• 分类号: S858
• 字数: 4714字
• 语种: 中文

摘要

为获得番鸭小鹅瘟病毒弱毒株(MDGPV-D)非结构蛋白NS基因的相关信息,根据已发表的MDGPV-PT株全基因序列,应用DNAStar分子生物学软件设计1对引物,采用高保真PCR技术扩增MDGPV-D株NS全基因序列.对番鸭小鹅瘟病毒疫苗弱毒D株(MDGPV-D) NS基因进行克隆、测序,并利用生物信息学技术分析MDGPV-D株NS蛋白的同源性、遗传衍化、N-糖基化位点、磷酸化位点、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位及其二级结构.结果表明,D株NS全基因大小为1 884 hp,编码627个氨基酸(GenBank登录号:JF926696),与MDPV NS基因的亲缘性最近核苷酸及其推导氨基酸同源性分别为97.9％～98.6％,97.6％～98.2％；MDGPV-D株NS蛋白具有3个潜在的N-糖基化位点和27个磷酸化位点,可能存在11个B细胞抗原表位,13个CD8+ CTL表位,10个CD4+ Th抗原表位；二级结构分析显示,α螺旋和无规则卷曲含量高,分别为40.67％、41.15％,而β转角仅占4.63％.与亲本强毒PT株相比,弱毒D株的NS蛋白存在2个定点突变,分别位于核苷三磷酸区域(第338位氨基酸)与CD4+ Th抗原表位(第225位氨基酸).