苹果EST-SSR引物的开发及部分品种亲缘关系分析

• 作者: 宋尚伟 张恒涛 张芳明 王娟 陶永焕
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 EST-SSR引物 亲缘关系 聚类分析 相似性系数
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 509-515
• 页数: 7页
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文

摘要

[目的]开发苹果EST-SSR引物,评价苹果种质资源的多样性与亲缘关系.[方法]利用NCBI数据库中苹果EST的SSR位点开发了35对EST-SSR引物,建立了苹果EST-SSR体系,并利用筛选出的16对引物对苹果品种资源的亲缘关系进行研究.[结果]118份基因组DNA共扩增出等位基因位点138个,位点数的变化从3到13不等,平均每对引物检测到8.62个位点,总的多态性比率为94.2％,各引物的多态性比例分布为81.8％～100％,相似系数为0.48～1.00.利用UPGMA法构建聚类树状图,在相似性系数0.65处可将118个供试材料分为5大组:其中第1组又可分为2个亚组,包含了绝大部分供试材料；第2、3、4和5组包含的品种数目分别为12个、1 1个、3个和2个;第5组与其他组亲缘关系较远,相似性系数仅为0.48.[结论]筛选出的16对EST-SSR引物可用于评价苹果种质资源间的遗传多样性.