不同物种Dock7基因编码区生物信息学分析

• 作者: 刘小辉 周荣艳 张天 李兰会 李祥龙 王建涛
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 物种 Dock7基因 生物信息学分析 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 12-17
• 页数: 6页
• 分类号: S811.6
• 字数: 4461字
• 语种: 中文

摘要

为了研究不同物种Dock7基因的遗传多样性,采用生物信息学的方法分析了人、倭黑猩猩、大猩猩、毛猩猩、东非狒狒、玻利维亚的灰鼠猴子、虎鲸、家马、白犀牛、雪貂、家牛、大熊猫、佛罗里达海牛、海象、欧洲兔、家猫、家绵羊、星鼻鼹鼠、北美鼠兔、裸鼢鼠、非洲跳鼠、八齿鼠、褐家鼠、小家鼠、袋獾、原鸡、爪蟾27个物种Dock7基因编码区(CDS),并对该基因的遗传多样性、氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、蛋白质二级结构进行了分析和预测.结果表明,在27个物种68条基因序列中共检测到1855个多态位点,生成28种单倍型,Dock7基因序列编码区种间存在丰富的遗传多样性,而种内变异极小,只在原鸡中发现一个变异位点.在所研究27个物种中,原鸡Dock7基因的氨基酸序列存在信号肽,其他26个物种Dock7基因的氨基酸序列均无信号肽.27个物种都没有跨膜结构域,表现为亲水性,蛋白质二级结构主要结构元件是自由卷曲和α-螺旋,Dock7蛋白呈酸性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兰会	河北农业大学动物科技学院	120	583	13.0	17.0
2	李祥龙	河北农业大学动物科技学院	65	311	9.0	14.0
4	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
7	刘小辉	河北农业大学动物科技学院	18	104	7.0	9.0
8	张天	河北农业大学动物科技学院	5	2	1.0	1.0
9	王建涛		4	3	1.0	1.0