基于碱基三周期性研究P53家族基因的特征

• 作者: 晏寒冰 朱平 王其强 谈承杰
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 数学
• 关键词: 碱基三周期性 功率谱 信噪比 P53家族基因 偏好性
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 296-309
• 页数: 14页
• 分类号: Q617|O29
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2013.30031

摘要

为了进一步研究P53抑癌基因的性质,采用信号处理和分析的方法,在Voss数值映射下,利用离散傅里叶变换,结合出现最大功率谱位置的频率与1/3的差值(d)及信噪比(R)两个指标,来讨论P53家族基因的碱基三周期性.选取人类P53家族(P53、P63和P73)DNA序列及家鼠P53家族DNA序列的外显子,讨论了其三周期性与外显子长度、碱基成分及碱基分布的关系,在三周期性的前提下分析了P53基因密码子的偏好性.结果表明:P53家族基因的短外显子(N＜100)碱基三周期性不显著,P53家族基因的较长外显子(100≤N＜ 1000)碱基三周期性较显著；具有三周期性的外显子GC、GC3含量较高,且GC含量和功率谱峰值显著相关,说明三周期性与碱基成分及分布相关；具有三周期性的外显子频谱最大值处为G或C的可能性高,且GC3含量高,R值与最优密码子使用频率正相关,说明功率谱峰值与P53家族基因密码子偏好性具有相关性.该研究结果对P53家族基因的进一步研究具有重要的理论和现实意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱平		60	186	7.0	12.0
2	谈承杰		6	10	2.0	3.0
3	王其强		3	2	1.0	1.0
4	晏寒冰		2	9	1.0	2.0