神经母细胞瘤SK-N-SH细胞在氯化钴模拟缺氧后侧群细胞基因表达谱的变化

• 作者: 柳龚堡 肖现民 董岿然 钟海军
• 来源期刊: 中华小儿外科杂志
• 关键词: 神经母细胞瘤 细胞低氧 RNA,信使
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 922-926
• 页数: 5页
• 字数: 4060字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-3006.2013.12.013

摘要

目的 探讨SK-N-SH神经母细胞瘤株在氯化钴模拟缺氧条件下侧群(side population,SP)细胞比例的变化及SP细胞基因表达谱的改变.方法 采用二氯化钴模拟缺氧条件,然后利用Hoechst 33342染料法,通过流式细胞仪紫外激光检测分选功能分选出缺氧及常氧SK-N-SH细胞中的SP细胞,利用Agilent 8×60K人(Human) G3表达谱芯片进行检测,并对基因芯片结果进行分析,以荧光定量PCR验证芯片结果.结果 SK-N-SH细胞株的SP细胞比例约为8.65％,缺氧后降至约2.08％;缺氧SP细胞和常氧SP细胞mRNA及lincRNA的表达谱存在明显差异.差异＞2倍的基因有5077 mRNA、1383 lincRNA、其中上调的有2550 mRNA、572 lincRNA,下调的有2527 mRNA、81 1 lincRNA.差异表达的基因主要涉及细胞周期、DNA复制、p53及MAPK信号通路等生物学过程.荧光定量PCR基因结果与芯片差异基因结果表达趋势一致.结论 缺氧使SP细胞比例下降,并使SP细胞mRNA和lincRNA的表达谱均发生显著改变,提示mRNA和lincRNA共同参与调节神经母细胞瘤SP细胞在缺氧环境中的生物学行为.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	肖现民	复旦大学附属儿科医院外科	176	823	13.0	19.0
2	董岿然	复旦大学附属儿科医院外科	94	269	8.0	11.0
3	柳龚堡	复旦大学附属儿科医院外科	20	50	4.0	6.0
4	钟海军	复旦大学附属儿科医院外科	9	12	2.0	3.0