肺表面活性蛋白A适配体的筛选与鉴定

• 作者: 刘利娟 张娟琨 张晓青 王伟 陈怡 陈超 高明昊
• 来源期刊: 分析化学
• 关键词: 肺表面活性蛋白A 指数式富集的配基系统进化 寡核苷酸适配子
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1659-1663
• 页数: 5页
• 字数: 3102字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1096.2013.30461

摘要

利用指数式富集的配基系统进化(Systematic evolution of ligands by exponential enrichment,SELEX)技术筛选肺表面活性蛋白A(Pulmonary Surfactant Protein A,SP-A)的寡核苷酸适配体.通过对循环次数、退火温度及引物比例的优化,建立了适合的筛选体系;筛选产物经克隆测序后,用DNAMAN软件初步分析其结构.最终确定以12个循环,55℃为退火温度及80∶1为引物比的反应条件;经过9轮循环筛选,随机ssDNA库与SP-A的结合率从1.3％上升到33％;AP-3和AP-2适配体的随机区含有保守序列TAC-GT,AP-3和AP-1适配体的随机区含有保守序列ACAG,且各适配体的二级结构均以茎-环结构为主.